唐至清，屬孝女鄉(xiāng)；元至清，屬三十一都。
1941年，置昌溪鄉(xiāng)，隸北岸區(qū)。
1944年8月，昌溪鄉(xiāng)、石潭鄉(xiāng)合并為石溪鄉(xiāng)。
1946年5月，復(fù)置昌溪鄉(xiāng)，隸北岸區(qū)。
解放后，1949年5月，改屬深渡區(qū)；同年10月，昌溪鄉(xiāng)改為鎮(zhèn)。
1952年，置昌溪、萬二、外河坑、鳳岐鄉(xiāng)，1955年合并為昌溪鄉(xiāng)，1958年10月隸北岸公社，1959年2月設(shè)立昌溪管理區(qū)。
1961年1月，成立昌溪公社，隸深渡區(qū)。
1983年公社改鄉(xiāng)。
1992年2月隸深渡工指委。