原為明代養(yǎng)馬之地，稱兔南馬房。成村后村內(nèi)人家多開旅店，清代初年京城赴髻山進(jìn)香的行人車馬多宿此地，故名。民國初期屬順義縣第三區(qū)，駐有警備小隊�？谷諔�(zhàn)爭時期，隸屬抗日聯(lián)合縣，為游擊隊與日偽軍雙方爭奪的要地，化名為“大廠”。1949年4月劃屬順義縣第二區(qū)。
村黨支部建于1948年。
該村在清代有恭親王府旗地。1941年1月平密興聯(lián)合縣縣長朱曉宣在此開辟抗日游擊區(qū)。1944年8月二區(qū)小隊拔除小店敵據(jù)點。
小店村位于楊鎮(zhèn)西南部，現(xiàn)有住戶345戶，人口957人，耕地面積2384畝。
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