斗頂村的建制沿著時代發(fā)展不斷變革，唐時隸屬于閩縣寧基里。
宋、元至明代中葉屬懷安縣。
明代下葉和清代歸屬侯官縣。
清末，屬侯官縣富村區(qū)。
民國時期，屬閩侯（林森）縣五區(qū)（新店區(qū)）。
中華人民共和國成立后，1949年12月屬福州市洪山區(qū)勝華鄉(xiāng)。
1955年9月屬戰(zhàn)坂鄉(xiāng)。
1961年稱斗頂大隊，屬戰(zhàn)坂大隊。
1978年稱斗頂大隊，屬環(huán)城區(qū)新店公社。
1984年稱斗頂村設(shè)立村民委員會，屬郊區(qū)新店鄉(xiāng)。
1992年稱斗頂村，屬郊區(qū)新店鎮(zhèn)；1995年稱斗頂村，屬晉安區(qū)新店鎮(zhèn)。