鹽茶村前身為鹽茶村和秦州村。
鹽茶村土改時(shí)為五區(qū)二鄉(xiāng)一行政。
1955年建鹽茶初級(jí)社。
1957年擴(kuò)建為鹽茶高級(jí)社。
1958年為敦煌人民公社紅敦大隊(duì)三中隊(duì)鹽茶生產(chǎn)隊(duì)。
1961年改名為呂家堡公社鹽茶大隊(duì)。
1966年又更名為紅敦公社紅旗大隊(duì)。
1969年又恢復(fù)為鹽茶大隊(duì)。
1983年3月改置村。
秦州村農(nóng)戶是清代秦州（現(xiàn)在的天水市）的徙民于此建秦州坊，后村以坊名。
土改時(shí)屬五區(qū)一鄉(xiāng)三行政。
1955年成立秦州初級(jí)農(nóng)業(yè)社，后和鹽茶合并為高級(jí)農(nóng)業(yè)社。
1958年改名為敦煌人民公社紅敦大隊(duì)一中隊(duì)鹽茶生產(chǎn)隊(duì)。
1961年為呂家堡人民公社秦州大隊(duì)。
1966年更名為紅衛(wèi)大隊(duì)。
1969年又恢復(fù)為秦州大隊(duì)。
1983年3月改置村。
2007年9月，秦州村省入鹽茶村。