明代（1368-1644年）從1372-1644年設甘肅鎮(zhèn)陜西行都司、甘州府。
甘州府下設左、中、右、前、后五衛(wèi)管轄甘州所屬區(qū)域。
五個墩隸屬中衛(wèi)所轄。
清代（1644-1725）繼承明沿制。
仍設甘肅鎮(zhèn)、陜西行都司，甘州五衛(wèi)。
甘州為鎮(zhèn)，行都司治所。
五個墩仍隸中衛(wèi)所治。
清順治七年（1650年）撤銷甘州前衛(wèi)、后衛(wèi)。
民國25年（1936年）張掖縣屬甘肅省第六行政督察區(qū)，區(qū)置武威，五個墩村隸屬不變。
民國26年（1937年）五個墩村設聯(lián)保鄉(xiāng)公所1941年撤銷民國34年（1945年）屬張掖縣新豐鄉(xiāng)管轄1956年籌建張掖市（地級）、張掖同時存在。
1957年市建置撤銷張掖縣屬張掖專區(qū)，張掖縣設25個鄉(xiāng)，五個墩屬沙井鄉(xiāng)2002年10月撤銷張掖專區(qū)，成立張掖市2004年沙井鄉(xiāng)改為沙井鎮(zhèn)五個墩村屬沙井鎮(zhèn)管轄。