明萬歷十四年（1586），張姓居民來此定居創(chuàng)鄉(xiāng)。
原屬饒平縣隆眼城都。
1949年屬澄�？h蘇北區(qū)。
1953年上墩、下長寧、上長寧、西浦、新樓，合稱下長寧鄉(xiāng)，屬澄�？h三區(qū)。
1957年屬十五鄉(xiāng)。
1958年9月成立澄�？h人民公社，屬第二支隊207團。
1959年設上墩生產大隊，屬蘇北人民公社。
1961年屬十五鄉(xiāng)人民公社。
1983年11月設區(qū)建鄉(xiāng)，上墩、下長寧、新樓、西浦合設下長寧鄉(xiāng)，屬十五鄉(xiāng)區(qū)。
1986年11月撤區(qū)置鎮(zhèn)，設上墩村，屬十五鄉(xiāng)鎮(zhèn)。
1990年設上墩管理區(qū)。
1995年屬蓮華鎮(zhèn)。
1998年設上墩村，沿用至今。