宋末元初（1271-1294），葉姓先祖從會(huì)城來五指尖山東麓建村，初名為葉家村。
明代請塾師黃立忠來此講學(xué)，黃立忠于水背娶妻何氏，與何氏生五子后定居此地。
清康熙年間的大型類書《古今圖書集成》已見水背橋、水背村的記載，清康熙縣志記屬瀧水都三圖。
清光緒十九年（1893）建水背新村于舊村西側(cè)。
民國時(shí)期屬富路鄉(xiāng)。
1951年改屬第七區(qū)沙路鄉(xiāng)。
1952-1957年屬第十一區(qū)坑背鄉(xiāng)（1955年第十一區(qū)改為崖西區(qū)）。
1958年屬崖西人民公社坑背管理區(qū)。
1959年成立水背大隊(duì)。
1984年與坑口合并為坑背鄉(xiāng)。
1986年分出稱水背村委會(huì)。
1988年稱水背管理區(qū)。
1999年稱水背村委會(huì)。
2002年崖南與崖西合并，屬崖門鎮(zhèn)，仍稱水背村委會(huì)。