民國時期,實行新憲制,改區(qū)、聯(lián)保為鄉(xiāng)(鎮(zhèn)),隸屬板壩鄉(xiāng);1958年,建立巧洞生產(chǎn)大隊,成立巧洞生產(chǎn)大隊管理委員會,隸屬巧馬區(qū)巧馬公社;1984年,冊亨縣行政區(qū)劃變動,巧洞生產(chǎn)大隊管理委員會更名為巧洞村民委員會,隸屬巧馬鄉(xiāng);1991年,實行建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū),巴金鄉(xiāng)、板街鄉(xiāng)、板其鄉(xiāng)和巧馬鄉(xiāng)的巧洞村合并為丫他鎮(zhèn),巧洞村委會隸屬丫他鎮(zhèn);1998年,巧洞村委會隸屬丫他鎮(zhèn);2007年,實行村級整合,巧洞村委會隸屬丫他鎮(zhèn);2016年,實行鄉(xiāng)鎮(zhèn)區(qū)劃調整,巧洞村委會隸屬丫他鎮(zhèn)。