清雍正八年(1730年),置古州廳后劃為南路苗寨。
民國六年(1917年),屬南區(qū)。
民國二十年(1931年),轄地分屬八蒙、高排2鄉(xiāng),東三區(qū)。
民國二十六年(1937年),屬興華聯(lián)保辦公處領(lǐng)地,隸五區(qū)。
民國二十九年(1940年),屬興華聯(lián)保隸三區(qū)。
民國三十二年(1943年),屬興華鄉(xiāng),直屬縣。
1950年11月,沿屬興華鄉(xiāng),隸五區(qū)。
1953年,置水尾鄉(xiāng)。
1954年,定威鄉(xiāng)的水盆村、計劃鄉(xiāng)的高望村劃歸水尾鄉(xiāng),隸八開區(qū)。
1957年1月2日,劃歸三都水族自治縣九阡區(qū)。
1958年9月,撤區(qū)鄉(xiāng)建公社,置英雄公社(水尾公社),隸九阡公社(大公社)。
1963年7月,回榕江縣,置水尾水族民族鄉(xiāng)管理委員會,隸八開區(qū)。
1964年,改置水尾公社管理委員會,隸八開區(qū)。
1984年,復(fù)置水尾水族民族鄉(xiāng)。
1992年,撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn),置水尾水族鄉(xiāng)。