1905年（清光緒31年）始設湯原縣時，南岔歸其管轄。
1946年（中華民國35年）南岔屬湯原縣第五區(qū)。
1952年12月南岔屬伊春縣第二區(qū)。
1955年9月12日，南岔（二區(qū)）改稱南岔鎮(zhèn)。
同時浩良河鎮(zhèn)（村級）從南岔劃出，另行組建浩良河區(qū)。
1957年11月南岔鎮(zhèn)改稱南岔區(qū)，隸屬伊春市。
1960年3月南岔區(qū)改稱南岔人民公社。
1962年12月復稱南岔區(qū)。
1964年8月17日根據(jù)伊春特區(qū)人民委員會《關于南岔區(qū)與南岔林業(yè)局合并的批示》，同年10月，南岔區(qū)與南岔林業(yè)局實行政企合一體制，隸屬伊春特區(qū)和伊春林業(yè)管理局。
1968年1月27日，經(jīng)伊春市革命委員會批準成立南岔區(qū)革命委員會。
1969年10月撤銷浩良河區(qū)并入南岔區(qū)。
1980年4月經(jīng)伊春市人民政府批準，撤銷南岔區(qū)革命委員會，成立南岔區(qū)人民政府。
2019年7月13日，伊春市召開動員大會，宣讀《國務院關于同意黑龍江省調(diào)整伊春市部分行政區(qū)劃的批復》，撤銷伊春市南岔區(qū)，設立南岔縣，以原伊春市南岔區(qū)的行政區(qū)域為南岔縣的行政區(qū)域。
2019年7月14日，南岔縣委掛牌成立；9月1日南岔縣人民政府掛牌成立。
南岔林業(yè)局沿革：1946年8月合江省林務局在南岔始設林務分局。
1949年南岔林務分局與湯原縣林務分局合并成湯原縣林務局，在南岔設林業(yè)辦事處。
1950年經(jīng)松江省決定，將南岔林區(qū)劃歸伊春森林工業(yè)管理局。
1951年7月伊春森林工業(yè)管理局撤銷鶴崗林務分局，其大部分人員遷至南岔，組建南岔森工分局，1953年6月29日與美溪森工分局合并為南岔森工分局。
同年7月3日，南岔森工分局改稱南岔森林工業(yè)局。
1954年7月隸屬東北森林工業(yè)管理局伊春分局。
1958年4月8日改稱南岔林業(yè)局，隸屬伊春林業(yè)管理局。
1961年11月，浩良河制材廠劃歸南岔林業(yè)局。
1964年10月南岔林業(yè)局與南岔區(qū)實行政企合一體制。
2015年3月，中共中央、國務院決定實施國有林區(qū)改革。
2019年2月26日，伊春森工南岔林業(yè)局有限責任公司掛牌成立。