相傳：堯舜時代，今黃龍廟所在地是一片湖泊，叫龍門湖。湖中有一條黃金魚，一條黑金魚。兩條金魚同時跳躍龍門，黃金魚一躍越過龍門，卻有半斤魚鱗掛在湖邊的黃楝樹上。這半片魚鱗吸取日月精華，天長日久，變成一個美男子在湖邊落腳。天上一位仙女看上了他，便下凡與之成親，繁衍后代。后來大禹治水，疏通河道，湖水流入大海，龍門湖變成陸地，形成村落。東漢時期，人們修廟，以紀念這個美麗的傳說，廟名叫黃鱗廟，供奉黃鱗演變的黃鱗爺。后來黃鱗又演變成黃龍爺，廟改名黃龍廟，村名叫做黃龍廟。
黃龍廟村位處軹城鎮(zhèn)政府駐地西南4公里的丘嶺地區(qū)。南接紅土溝村，北連柿花溝村，東依衛(wèi)溝、桐花溝，西臨廟后、泥溝河。轄區(qū)有溝東、下園、溝南、溝北、趙圪套、西南溝、廟溝、西嶺、龍門河、小衛(wèi)洼等10個自然村，15個居民組，427戶，2038人，耕地2000畝，林地250畝。村以李姓（明洪武十年左右山西移民）為主占總?cè)丝?5.8%，余姓為趙（清同治四年逃難于山東平陰）劉、王、石、衛(wèi)、湯、陳、孫、任、周、宋、侯、馬（2001年由大峪亂石遷入）等，均為漢族。1950年，二區(qū)建黃龍廟鄉(xiāng)，鄉(xiāng)公所駐黃龍廟村，1954年小鄉(xiāng)變大鄉(xiāng)，黃龍廟鄉(xiāng)管轄趙莊、雁門、紅土溝鄉(xiāng)，鄉(xiāng)公所移駐紅土溝村。1958年，黃龍廟村成為獨立的行政單位。
黃龍廟村教育起步較早。1943年辦學，校名育英學校。1950年，更名黃龍廟小學，招收1—4年級學生。1955年改名完全小學，招收五年級學生。1969年，設(shè)立初中部，招收初中生。1976年設(shè)立民辦高中，招收一屆學員。1977年后，軹城高中在此辦兩年補習班。1994年初中、小學分設(shè)，初中部更名為軹城鎮(zhèn)四中。2005年初中取消，成立軹城鎮(zhèn)黃龍廟村中心小學，生員覆蓋黃龍、翟莊、丁斗、雁門、泥溝河、泗澗、紅土溝、衛(wèi)溝、戰(zhàn)天洞、毛田、洪溝等11個行政村。迄今為止，黃龍廟學校培養(yǎng)出李希賢、李繼明、劉純敏、李栓根等政界要員，培養(yǎng)了李興軍、石小占、王懷立、石懷仁、石恒心等文化、醫(yī)學名人。
黃龍廟村村企始于20世紀50年代中期，先后有村辦木業(yè)社、鐵業(yè)社、藥鋪和運輸隊。1971年，各種小型企業(yè)迭起，有機磚廠、鑄鐵廠、粉房，生產(chǎn)青色機磚、水泥廠球磨機用鐵球、爆米花機和粉條，集體經(jīng)濟逐步壯大。1980年，投資8萬元建起面粉廠。1987年，投資60萬建起年產(chǎn)值約60萬元的水晶石廠。后或因市場變化、經(jīng)營不善停辦。迄今為止，村留存兩家私營企業(yè)（飲料廠和制瓶廠），年產(chǎn)值約1800萬元。
黃龍廟村以農(nóng)業(yè)為主，土地貧瘠，靠天吃飯。1955年，修建黃龍廟水庫，可灌溉土地百余畝�！稗r(nóng)業(yè)學大寨”運動中，大隊平整了大量土地，加固黃龍廟水庫大壩，修建趙圪套、西南溝提灌站兩處，“引沁濟蟒”的六干渠、八干渠、加斗渠通水后，村里投資53萬元（市水利局投資20萬元，自籌33萬元），建水利大壩，通灌溉支渠、毛渠5000余米，建提灌站8處，可灌溉耕地達1600余畝，糧產(chǎn)每畝上千斤。全村有大型農(nóng)耕機械23臺，其中收麥機8臺，收玉米機2臺，大型拖拉機13臺，耕種、收割全部實現(xiàn)機械化。村人發(fā)展多種經(jīng)營，經(jīng)濟林250余畝，養(yǎng)殖專業(yè)戶23家，其中養(yǎng)豬20戶，年存欄保持在4000頭左右。養(yǎng)兔3戶，年出欄穩(wěn)定在3000只左右。2005年，人均收入激增到7500元。
2006年，黃龍廟村新農(nóng)村建設(shè)起步。全村建起沼氣池420個，占總農(nóng)戶的95%。2007年，投資170萬元填深溝一條，筑攔河大壩一座，修村道1.1公里。2010年，投資40萬元興建文化廣場。2011年，修建村衛(wèi)生所。2015年，全村街道硬化。