民國時期屬六合鄉(xiāng)、樓碧鄉(xiāng)轄。
1949年10月屬王店區(qū)轄。
1952年10月屬第四區(qū)組寺鄉(xiāng)轄。
1954年8月后祖寺并入柏橋，屬雷公區(qū)柏橋鄉(xiāng)轄。
1956年3月屬雷公區(qū)六合鄉(xiāng)轄。
1956年4月屬第五指導(dǎo)小組六合鄉(xiāng)轄。
1958年9月屬英雄人民公社六合管理區(qū)轄。
1961年4月，組寺大隊屬雷公區(qū)六合人民公社轄。
1975年2月屬雷公人民公社六合管理區(qū)轄。
1984年1月雷公區(qū)六合鄉(xiāng)轄。
1987年3月后屬雙河鎮(zhèn)轄。
2001年4月后并入雷公鎮(zhèn)，祖寺村村民委員會屬雷公鎮(zhèn)管轄，沿用至今。