清為馮家灘會(huì),民國(guó)時(shí)屬廉讓鄉(xiāng)。
1949年10月現(xiàn)紅旗村所轄區(qū)域名為辛民十二社,屬巡店區(qū)高店鄉(xiāng)管轄。
1952年10月屬第二區(qū)高店鄉(xiāng)轄;1956年3月為第三指導(dǎo)小組高店鄉(xiāng)轄,1958年9月,辛民十二社改為紅旗大隊(duì),屬幸福人民公社高店管理區(qū)轄,同年底屬巡店區(qū)高店人民公社轄。
1975年2月屬巡店人民公社高店管理區(qū)轄。
1984年1月,紅旗大隊(duì)改為紅旗村,屬巡店鎮(zhèn)高店鄉(xiāng)轄。
1987年10月屬辛榨鄉(xiāng)轄。
2009年,紅旗村改名為紅旗社區(qū),屬辛榨鄉(xiāng)轄,沿用至今。