該地明清時曾屬安平上鄉(xiāng)清化里；民國時期曾屬蘄廣邊縣委領導的紅色革命區(qū)，其縣委辦公點設在邱山村竹林塆；1951年屬城關區(qū)雨臺鄉(xiāng)；1956年為黃土嶺指導區(qū)菩堤一新五、六社；1959年為蘄州公社菩堤五大隊；1961年為赤東區(qū)菩堤公社五大隊；1975年撤區(qū)并社，更名為邱山大隊，屬赤東公社；1984年2月設區(qū)建鄉(xiāng)，更名為邱山村，屬赤東區(qū)菩堤鄉(xiāng)；1987年9月撤區(qū)并鄉(xiāng)，屬黃土嶺鄉(xiāng)；2001年2月行政區(qū)劃調整，屬蘄州鎮(zhèn)至今。