咸寧市行政建置比較晚，但境內(nèi)各縣（市、區(qū)）歷史悠久，源遠(yuǎn)流長。
區(qū)域周為楚地，隸屬南郡，漢屬荊州江夏郡，東漢末屬東吳。
漢初置沙羨縣，咸寧、嘉魚、蒲圻屬之；崇陽、通城屬南郡下雋縣。
三國時(shí)屬吳，吳黃武二年（223）置蒲圻縣。
唐代宗大歷三年（768）置永安鎮(zhèn)。
南唐保大十三年（955）升為永安縣。
宋景德四年（1007）易名咸寧縣。
南唐保大十一年（953）置嘉魚縣。
北宋乾德二年（964）置通山縣。
北宋開寶八年（975）置崇陽縣。
北宋熙寧五年（1072）置通城縣。
公元1135年崇陽、通城復(fù)并，1145年復(fù)析。
元代時(shí)，咸寧、嘉魚、通城、蒲圻、崇陽屬湖廣行省武昌路，通山隸江淮行省蘄黃道，不久改隸湖廣行省興國路。
明、清時(shí)期，轄區(qū)均屬武昌府。
民國21年（1932年），通山屬湖北省第二行政督察區(qū)，其他縣屬第一行政督察區(qū)。
1936年，通山改屬第一行政督察區(qū)。
1949-1952年，咸寧、崇陽、通山、通城屬大冶專區(qū)。
1952年撤銷大冶專區(qū)，咸寧、嘉魚、通山、通城、蒲圻、崇陽改屬孝感地區(qū)。
1960年1月4日國務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷孝感專區(qū)，咸寧縣隸屬武漢市。
1960年8月15日國務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷蒲圻縣，其行政區(qū)域并入并入咸寧縣。
1961年4月24日國務(wù)院批準(zhǔn)，恢復(fù)孝感專區(qū)，咸寧縣隸屬孝感專區(qū)。
1961年12月15日國務(wù)院批準(zhǔn)，恢復(fù)蒲圻縣，以原蒲圻縣并入咸寧縣的行政區(qū)域?yàn)槠湫姓䥇^(qū)域。
1965年7月19日國務(wù)院批準(zhǔn)，恢復(fù)咸寧專區(qū)，領(lǐng)導(dǎo)孝感專區(qū)的咸寧、武昌、通山、崇陽、通城、蒲圻、嘉魚7縣和黃岡專區(qū)的陽新縣、鄂城2縣。
1968年咸寧專區(qū)改稱咸寧地區(qū)。
1975年11月和1979年11月，武昌、鄂城分別劃屬武漢市、黃岡地區(qū)。
1983年8月19日，《國務(wù)院關(guān)于湖北省地市行政體制改革方案的批復(fù)》（83）國函字164號(hào)，撤銷咸寧縣，設(shè)立咸寧市（縣級(jí)），由咸寧地區(qū)領(lǐng)導(dǎo)。
1986年5月27日，《國務(wù)院關(guān)于湖北省設(shè)立應(yīng)城、蒲圻、仙桃、石首、麻城、利川市的批復(fù)》國函〔1986〕70號(hào)，撤銷蒲圻縣，設(shè)立蒲圻市（縣級(jí)），以原蒲圻縣的行政區(qū)域?yàn)槠眼呤械男姓䥇^(qū)域。
1996年12月，陽新改屬黃石市。
1998年6月11日，《關(guān)于湖北省蒲圻市更名為赤壁市的批復(fù)》民行批〔1998〕22號(hào)，蒲圻市更名為赤壁市。
1998年12月6日，《國務(wù)院關(guān)于同意湖北省撤銷咸寧地區(qū)設(shè)立地級(jí)咸寧市的批復(fù)》國函〔1998〕103號(hào)，撤銷咸寧地區(qū)和縣級(jí)咸寧市，設(shè)立地級(jí)咸寧市。
咸寧市設(shè)立咸安區(qū)，以原縣級(jí)咸寧市的行政區(qū)域?yàn)橄贪矃^(qū)的行政區(qū)域。
原咸寧地區(qū)的赤壁市由咸寧市代管。