清末，屬河南南陽(yáng)府淅川廳三官殿區(qū)，民國(guó)，屬河南南陽(yáng)公署淅川縣東二區(qū)（機(jī)關(guān)駐地三官殿），1948年5月3日淅川全境解放。
1956年合作化時(shí)期為淅川縣三官殿區(qū)三官殿社，1958年人民公社化時(shí)期，由街東、街西、街南、溝南四個(gè)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社組建成三官殿生產(chǎn)大隊(duì)，屬淅川縣三官殿公社管轄。
1968年遷居鐘祥縣大柴湖區(qū)后，更名為紅旗生產(chǎn)大隊(duì)。
1975年11月，撤區(qū)并社屬大柴湖公社紅旗管理區(qū)紅旗生產(chǎn)大隊(duì)；1980年地名普查時(shí)仍為紅旗生產(chǎn)大隊(duì)。
1984年3月，設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)屬大柴湖區(qū)紅旗公社紅旗村；1987年9月，撤區(qū)建鎮(zhèn)時(shí)將“大”去掉屬柴湖鎮(zhèn)紅旗管理區(qū)紅旗村至今。