民國二十五年（1936）屬鐘祥縣第三區(qū)（石牌）濱漢鄉(xiāng)管轄，民國三十年（1941）、民國三十五年（1946）屬鐘祥縣石牌鎮(zhèn)管轄；解放后，1950年屬鐘祥縣第六區(qū)（石牌）王龍鄉(xiāng)管轄，下設(shè)生產(chǎn)互助組、初級社；1956年取名聯(lián)興社；1958年撤銷區(qū)制，成立人民公社，改稱石牌人民公社王龍管理區(qū)聯(lián)豐大隊；1961年撤社建區(qū)，改稱石牌區(qū)王龍人民公社瑞豐大隊；1975年撤區(qū)并社，改稱石牌人民公社王龍管理區(qū)瑞豐大隊；1980年以村域內(nèi)馬祠得名馬祠大隊；1984年地名普查后命名馬祠村村民委員會；1987年撤區(qū)建鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），改稱石牌鎮(zhèn)馬祠村村民委員會沿用。