清雍正七年（1729年），靛房鎮(zhèn)境域?qū)倨履_里。
民國(guó)元年（1912年），靛房屬坡腳鄉(xiāng)。
1950年，原坡腳鄉(xiāng)撤銷，成立坡腳片區(qū)和靛房片區(qū)，隸屬龍山縣人民政府第四區(qū)。
1956年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，山峰鄉(xiāng)、百型鄉(xiāng)、七政鄉(xiāng)并入靛房鄉(xiāng)，客寨鄉(xiāng)、亞木鄉(xiāng)、多谷鄉(xiāng)、報(bào)格鄉(xiāng)合并為坡腳鄉(xiāng)，原半南鄉(xiāng)、梭多鄉(xiāng)劃入他砂鄉(xiāng)。
1958年，靛房鄉(xiāng)改為靛房人民公社，坡腳鄉(xiāng)改為坡腳人民公社。
1984年4月，靛房公社、坡腳公社改社建鄉(xiāng)。
2000年，靛房鄉(xiāng)改為靛房鎮(zhèn)。
2005年，原坡腳鄉(xiāng)并入靛房鎮(zhèn)。