唐、五代屬徽州。
宋元豐四年（1081年），屬府竹縣。
宋崇寧二年（1103年），屬綏寧縣。
元、明，屬黃石里。
清嘉慶、民國期間，稱長鋪子市。
1949年10月，屬綏寧縣第二區(qū)。
1954年10，縣治遷長鋪鄉(xiāng)。
1956年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，設立長鋪鎮(zhèn)。
1958年，撤鄉(xiāng)設公社，屬長鋪人民公社。
1959年，長鋪人民公社析置長鋪鎮(zhèn)城市人民公社（后改稱長鋪鎮(zhèn)）。
1960年，改為縣直轄鎮(zhèn)。
1961年，為區(qū)級鎮(zhèn)。
1995年8月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，長鋪子苗族鄉(xiāng)并入長鋪鎮(zhèn)。
1997年2月，長鋪鎮(zhèn)析置長鋪子苗族鄉(xiāng)。