據(jù)《奉天通志》、《輝南廳志》記載和輝發(fā)城出土的文物證明，輝發(fā)城遠(yuǎn)在新石器時(shí)代就有勞動(dòng)人民在此生息繁衍，過(guò)著狩獵生活，并開(kāi)始了農(nóng)耕。
清代初期，這里被封禁為盛京圍場(chǎng)。
清光緒五年（1879）設(shè)置海龍廳時(shí)，歸海龍廳的海興社管轄。
光緒二十八年（1902）盛京圍場(chǎng)全部開(kāi)禁，逐漸形成居落，海龍廳升為府。
宣統(tǒng)元年（1909）海龍府劃出東南8社，設(shè)立輝南直屬?gòu)d，歸輝南廳海興社管轄。
1913年廢廳改縣，改為輝南縣，本鎮(zhèn)屬之。
1919年輝南縣將8個(gè)社改為8個(gè)區(qū)，歸第二區(qū)管轄。
1923年（中華民國(guó)12年），輝南縣將8個(gè)區(qū)改為8個(gè)社，原冠于社首的“海”字改為“輝”字，歸輝興社管轄。
1925年輝南縣將8個(gè)社改為4個(gè)區(qū)，歸第三區(qū)管轄。
1928年廢除區(qū)制。
1936年日偽推行街村制時(shí)，在輝發(fā)城設(shè)村公所。
1945年11月，輝南縣民主聯(lián)合政府成立后，把全縣劃為8個(gè)區(qū)，為六區(qū)（輝發(fā)城區(qū)。
1956年3月，改區(qū)村制為鄉(xiāng)鎮(zhèn)制，由原六區(qū)的輝發(fā)城村、保安村組成輝發(fā)城鄉(xiāng)。
1958年3月，全縣鄉(xiāng)鎮(zhèn)調(diào)整，長(zhǎng)春堡鄉(xiāng)并入輝發(fā)城鄉(xiāng)。
1958年9月，人民公社化中，由原輝發(fā)城鄉(xiāng)、中央堡鄉(xiāng)的12個(gè)高級(jí)社組成紅星人民公社。
1961年，全縣人民公社調(diào)整，紅星人民公社改為輝發(fā)城人民公社，劃出建立中央堡人民公社、蛟河口人民公社、慶陽(yáng)人民公社，輝發(fā)城人民公社。
1962年，全縣人民公社調(diào)整，輝發(fā)城人民公社。
1979年，輝發(fā)城人民公社把原光輝大隊(duì)分為光明、秦家、大屯3個(gè)大隊(duì)。
1982年，全縣調(diào)整生產(chǎn)大隊(duì)和生產(chǎn)隊(duì)，輝發(fā)城人民公社。
1983年，全縣對(duì)人民公社體制進(jìn)行改革，改為輝發(fā)城鄉(xiāng)。
1986年1月7日，經(jīng)吉林省人民政府批準(zhǔn)，根據(jù)輝政辦發(fā)〔1986〕2號(hào)文件，撤銷(xiāo)輝發(fā)城鄉(xiāng)，設(shè)立輝發(fā)城鎮(zhèn)。
2005年2月5日，全縣部分鄉(xiāng)鎮(zhèn)行政區(qū)劃調(diào)整時(shí)，撤銷(xiāo)蛟河口鄉(xiāng)，將其所轄行政區(qū)域并入輝發(fā)城鎮(zhèn)。