據(jù)縣志及史料記載.清人工鄉(xiāng)境為封禁圍場。
1877年設(shè)通化縣時,歸通化縣北境養(yǎng)字路休養(yǎng)保轄。
1902年設(shè)柳河縣時,仍歸休養(yǎng)保轄。
入民國為孤山子村。
1931年九·一八事變后被偽統(tǒng)治，1936年8月，日寇實行集家并屯后，為歸第六區(qū)轄。
1947年解放后為第五區(qū)人民政府。
1956年春改區(qū)為鄉(xiāng)。
1958年9月成立孤山子人民公社。
1980年3月改為孤山子人民公社管理委員會。
1983年9月改社為鄉(xiāng)。
1985年4月改鄉(xiāng)為鎮(zhèn)，改為孤山子鎮(zhèn)。