北宋建隆三年（962）起，屬昌邑縣。
1945年秋，建昌南縣轄飲馬。
1948年，為飲馬區(qū)。
1950年7月，改為昌南四區(qū)。
1956年4月，撤昌南縣并入昌邑縣，仍為飲馬區(qū)。
1958年2月，改為飲馬鄉(xiāng)，9月，與鰲頭鄉(xiāng)合并成立東升公社，12月，改稱飲馬公社，轄16個大隊(duì)、215個生產(chǎn)小隊(duì)。
1983年5月，改為飲馬鄉(xiāng)，轄42個行政村。
1984年5月，撤鄉(xiāng)設(shè)飲馬鎮(zhèn)。
2007年8月，撤銷石埠鎮(zhèn)、岞山鎮(zhèn)，并入飲馬鎮(zhèn)。
2009年5月，西北院等48個行政村劃歸坊子區(qū)太保莊鎮(zhèn)，10月，北孟鎮(zhèn)小營村劃入飲馬鎮(zhèn)。