清朝末年為費縣接輿、東柳、馬山三個社所轄。
1945年，為費縣二區(qū)。
1947年，西部為費縣崮口區(qū)（九區(qū)）。
1948年10月，東部為費縣馬莊區(qū)（二區(qū)），將東單、九莊劃屬臨沂縣，同時將臨沂縣的沂艾莊、許家莊、劉莊、西單和萬家莊、墩西莊的半個莊劃屬費縣馬莊區(qū)。
1956年，九區(qū)撤銷時將尚莊、宋莊、蓮花、崮口四個鄉(xiāng)劃歸二區(qū)。
1958年春，撤區(qū)改為劉莊、馬莊、尚莊三個鄉(xiāng)，同年秋，成立三個公社，同年冬,合并為馬莊公社，緊接著改為馬莊區(qū)。
1971年6月，又改為馬莊人民公社。
1976年3月，將城子、劉莊兩個管理區(qū)的24個大隊劃屬新置的劉莊公社，同年新莊公社的陳家圍子大隊劃屬該社，將小安子大隊劃屬新莊公社。
1985年9月，改為馬莊鎮(zhèn)。
2011年8月，撤芍藥山鄉(xiāng)，整體并入馬莊鎮(zhèn)，境域始成現(xiàn)狀。