建九戶鎮(zhèn)自漢朝有考。
后漢時期屬濟南郡東朝陽縣；南北朝屬濟南郡朝陽縣。
隋開皇六年朝陽縣改為臨濟縣，九戶之域又屬臨濟縣。
宋朝臨濟縣折入鄒平、章丘兩縣。
九戶之域?qū)汆u平縣。
元代將鄒平、章丘兩縣各一部分成立齊東鎮(zhèn)。
憲宗二年（1252）立齊東縣，九戶屬齊東縣。
明清兩代九戶均屬濟南府齊東縣。
齊東縣原治所趙巖口（今臺子）。
光緒二十年被水淹，縣治始遷至九戶鎮(zhèn)。
民國時期到建初期，均屬山東省境域原屬齊東縣。
1949年為九戶區(qū)，1958年11月份，齊東縣撤銷并入鄒平縣，建九戶公社，1961年改區(qū)，1966年并入孫鎮(zhèn)區(qū)，1968年復(fù)設(shè)九戶公社，1984年改鄉(xiāng)，1996年12月撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。