漢時(shí)為潼亭。
民國(guó)三十三年（1944年）前，各村莊分屬潼關(guān)、華陰、閿鄉(xiāng)3縣，政區(qū)無(wú)考。
同年，轄區(qū)有南劉、蘇家、南街、凹里、十里鋪、西北等屬城關(guān)鎮(zhèn)；西廒、金盆屬桃林鄉(xiāng)；寺角營(yíng)、荒移、楊家莊屬漢城鄉(xiāng)；新城堡、四知、公莊、小泉屬四知鄉(xiāng)。
1951年，蘇家、南劉、南街、十里鋪、西北屬第一區(qū)，公莊、四知、桃林寨、新城堡、小泉屬第二區(qū)，金盆、西廒屬第三區(qū)，寺角營(yíng)、荒移、楊家莊屬第四區(qū)。
1955年，撤區(qū)并鄉(xiāng)后，各村分屬城關(guān)鎮(zhèn)、吊橋鄉(xiāng)、十里鋪鄉(xiāng)。
1961年，恢復(fù)潼關(guān)縣建制后，設(shè)港口公社，轄1個(gè)社區(qū)和11個(gè)生產(chǎn)隊(duì)。
1984年，改為港口鎮(zhèn)。
1994年8月，從港口鎮(zhèn)中分出凹里、十里鋪、西北，設(shè)橋頭鎮(zhèn)。
1995年7月，更名為秦東鎮(zhèn)。
2002年1月，港口鎮(zhèn)、秦東鎮(zhèn)合并為秦東鎮(zhèn)，人民政府駐原港口鎮(zhèn)。
2010年8月，將高橋鄉(xiāng)的新城堡、四知（吊橋）、公莊、桃林寨、小泉5個(gè)行政村劃歸秦東鎮(zhèn)。