春秋時屬晉。
戰(zhàn)國時屬秦。
秦屬內史。
秦始皇二十六年（前221年)設商縣，因商山得名，包括今商州區(qū)、丹鳳縣、商南縣、山陽4縣地。
西漢時東北部屬弘農郡，其治所在弘農(今河南靈寶貌略鎮(zhèn)北)，西南部屬漢中郡，今柞水縣西北部屬京兆尹。
東漢大部屬京兆尹，南部屬南陽郡，西南部屬漢中郡。
三國魏時，大部屬京兆郡，今鎮(zhèn)安縣、柞水縣西北部屬魏興郡。
晉泰始二年（266年）分京兆南部于上洛縣（今商州區(qū)）置上洛郡，轄上洛、商縣、豐陽3縣。
北魏時屬洛州，太延五年(439年)于上洛城置荊州；太和十一年(487年)又遷往襄陽，撤上洛郡，設洛州；太河十三年（489年）改置洛州，分設上洛郡、上庸郡、魏興郡、萇和郡等5郡；景明元年（500年）分上洛郡地于商南縣，置萇和郡；永平四年（511年）置上庸郡。
西魏大統(tǒng)三年（537年）增設拒陽郡。
北周保定元年（561年）撤銷萇和郡、魏興郡，設立慎政郡。
宣政元年（578年）洛州更名商州，領上洛郡、拒陽郡。
隋開皇三年（583年)撤上洛、上庸、拒陽、慎政四郡，大業(yè)三年(607年)廢商州復設上洛郡。
唐武德元年(618年)廢上洛郡復設商州，貞觀元年(627年)劃歸山南道，開元二十五年(738年)歸山南西道。
天寶元年(742年)再撤商州設上洛郡，乾元元年(758年)又撤上洛郡設商州，縣治設上洛(今商州區(qū))，領上洛縣（今商州區(qū)）、商洛縣（今丹鳳縣、商南縣）、洛南縣（今洛南縣）、豐陽縣（今山陽縣）、乾元縣（今鎮(zhèn)安縣及柞水縣東南部）、上津縣（今湖北省境內）。
北宋初屬陜西路，后屬永興軍路，領5縣。
金屬京兆府路，元光二年(1223年)改屬河南路。
南宋屬利州路。
元先屬安西路，后屬奉元路。
明屬西安府，時稱商州，轄今商州區(qū)、丹鳳縣，明洪武七年(1374年)降商州為商縣。
成化十三年(1477年)復升為商州，領洛南、商南、山陽、鎮(zhèn)安4縣。
天啟元年（1621年）為避名諱，改“洛”為“雒”。
清雍正三年(1725年)升為直隸州，直屬陜西省，領商南、雒南、山陽、鎮(zhèn)安4縣。
1913年廢州，商縣（今商州區(qū)、丹鳳縣西南部）、雒南（今洛南及丹鳳縣東北部）、柞水（今柞水縣西部及鎮(zhèn)安縣東北部）三縣屬關中道，山陽、商南、鎮(zhèn)安三縣屬漢中道。
1928年廢道屬省。
1935年在商縣城設第四行政督察區(qū)，轄商縣、雒南、商南、山陽、鎮(zhèn)安、柞水6縣。
1949年5月設陜甘寧邊區(qū)商雒分區(qū)，轄商縣、雒南、商南、丹鳳、山陽、鎮(zhèn)安、柞水7縣。
1950年5月，改設為商雒專區(qū)，仍轄7縣。
1958年12月，撤銷丹鳳、柞水2縣(丹鳳縣分屬商南和商縣，柞水與鎮(zhèn)安縣合并)，轄商縣、洛南、商南、山陽、鎮(zhèn)安5縣。
1961年10月復設丹鳳、柞水2縣，轄7縣。
1964年9月，因“雒”字生僻，改“雒”為“洛”，名商洛專區(qū)，轄7縣。
1969年，改為商洛地區(qū)，轄7縣。
1988年6月改商縣為商州市（縣級）。
2001年8月撤銷商洛地區(qū)，設立地級商洛市；原縣級商州市改設商州區(qū)；共轄1區(qū)6縣。