清同治年間（1862—1874年），建鎮(zhèn)。
清光緒十八年（1892年），屬加陽里所轄。
民國初年為懷陽聯(lián)保駐地，后屬丹陽鄉(xiāng)所轄。
民國二十七年至民國三十四年（1938—1945年），為山西省政府即二戰(zhàn)區(qū)司令長(zhǎng)官閻錫山西渡黃河后駐地，當(dāng)時(shí)改秋林為“興旗鎮(zhèn)”，抗戰(zhàn)勝利后恢復(fù)原名。
民國三十五年（1946年），隸屬丹陽鄉(xiāng)。
民國三十七年（1948年）3月，隸屬丹陽區(qū)。
1951年，屬交里區(qū)。
1957年7月，設(shè)秋林鄉(xiāng)。
1960年2月，成立秋林公社。
1984年12月，復(fù)設(shè)鄉(xiāng)。
1998年8月，改設(shè)鎮(zhèn)。
2001年11月，撤銷鹿川鄉(xiāng)并入秋林鎮(zhèn)。