清宣統(tǒng)二年（1910年），設(shè)吉安鄉(xiāng)。
民國三年（1914年），改為地方試行自治，屬南區(qū)，吉安鎮(zhèn)下轄吉安、李渡2場(chǎng)。
民國二十九年（1940年），設(shè)吉安鄉(xiāng)，屬飛龍區(qū)。
1950年，改為南充縣第五區(qū)，吉安鎮(zhèn)下轄仁和、吉安等5鄉(xiāng)。
1951年1月，設(shè)吉安鄉(xiāng)。
1958年10月，吉安鄉(xiāng)改為吉安公社。
1984年，由吉安公社改為吉安鄉(xiāng)。
1992年，雙店、臨江2鄉(xiāng)并入吉安鄉(xiāng)，由吉安鄉(xiāng)改為吉安鎮(zhèn)。
1994年，吉安鎮(zhèn)析出雙店鄉(xiāng)。
1997年，吉安鎮(zhèn)析出臨江鄉(xiāng)。
2019年10月29日，撤銷華興鎮(zhèn)和雙店鄉(xiāng)，劃歸吉安鎮(zhèn)管轄。