解放初屬漁箭鄉(xiāng)加強(qiáng)村。
1958年屬漁箭公社四管區(qū)。
1961年為漁箭公社四大隊(duì)。
1981年地名普查時(shí)改為漁箭公社石廟子大隊(duì)。
1984年改為石廟子村。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)擴(kuò)建鎮(zhèn)時(shí)劃歸石碾鎮(zhèn)管轄。
1997年成立漁箭管理區(qū)委員會(huì)，隸屬漁箭管理區(qū)委員會(huì)。
1999年元月后隸屬漁箭鎮(zhèn)。
2019年12月鄉(xiāng)鎮(zhèn)行政區(qū)劃調(diào)整改革時(shí)漁箭鎮(zhèn)并入石碾鎮(zhèn)，隸屬石碾鎮(zhèn)，2020年5月村級(jí)建制調(diào)整改革時(shí)黑水凼村和石廟子村合并為石廟子村，隸屬石碾鎮(zhèn)。