漢為伊吾盧地，神爵三年(前59)隸西域都護(hù)府。
東漢永平十六年(73)置宜禾都尉。
三國(guó)時(shí)魏置宜禾伊吾都尉，后屬柔然、西突厥。
隋大業(yè)六年(610)設(shè)伊吾郡和柔遠(yuǎn)鎮(zhèn)。
唐貞觀四年(630)置西伊州，領(lǐng)伊吾、納職、柔遠(yuǎn)3縣，隸隴右道。
宋屬高昌回鶻。
元代為威武王納忽里的封地，隸甘肅行省。
明永樂四年(1406)設(shè)哈密衛(wèi)。
明末屬東察合臺(tái)汗國(guó)。
清初屬準(zhǔn)噶爾部。
清乾隆二十四年(1759)設(shè)哈密辦事大臣。
三十八年(1773)在今巴里坤置鎮(zhèn)西府，轄奇臺(tái)、宜禾2縣，隸鎮(zhèn)迪道。
咸豐三年(1853)裁府設(shè)鎮(zhèn)西直隸廳。
光緒十年(1884)設(shè)哈密直隸廳，與鎮(zhèn)西直隸廳同屬鎮(zhèn)迪道。
民國(guó)二年(1913)改哈密直隸廳為哈密縣，改鎮(zhèn)西直隸廳為鎮(zhèn)西縣，隸屬迪化道。
1934年析迪化行政區(qū)設(shè)哈密行政區(qū)，行政長(zhǎng)公署設(shè)在哈密，轄哈密、鎮(zhèn)西2縣。
1943年改為哈密督察專區(qū)，轄哈密、伊吾、鎮(zhèn)西3縣。
1949年成立哈密專員公署，駐哈密，轄哈密、鎮(zhèn)西、伊吾3縣和七角井中心區(qū)。
1953年鎮(zhèn)西縣更名巴里坤縣，1954年撤銷七角井中心區(qū)。
1970年改為哈密地區(qū)，轄哈密縣、鄯善縣、巴里坤哈薩克自治縣和伊吾縣。
1977年哈密縣分設(shè)市、縣。
1983年哈密市縣合并建哈密市。
地區(qū)首府哈密市，在烏魯木齊東595千米。
轄1市、2縣，即哈密市、伊吾縣和巴里坤哈薩克自治縣。
2016年撤銷哈密地區(qū)成立地級(jí)哈密市，轄1區(qū)、2縣，即伊州區(qū)、巴里坤哈薩克自治縣、伊吾縣。