西漢歷史上和西漢版圖內(nèi)被稱為“渠犁”，為西域三十六國(guó)之一。
神爵三年（前59），漢朝在烏壘（今輪臺(tái)策大雅）設(shè)西域都護(hù)府。
唐貞觀十四年（640），設(shè)安西都護(hù)府于高昌（后遷龜茲），下轄天山以南焉耆、龜茲、毗沙、疏勒等都督府，庫(kù)爾勒歸焉耆都督府管轄。
12至13世紀(jì)，庫(kù)爾勒地區(qū)屬西遼。
元建立別失八里行尚書省。
庫(kù)爾勒隸于別失八里。
1758年，清朝先后平定準(zhǔn)噶爾與大小和卓，在庫(kù)爾勒實(shí)行伯克制，設(shè)阿奪木伯克1人，級(jí)別三品，屬喀喇沙爾辦事大臣管轄。
1884年，新疆建省后，焉耆設(shè)喀喇沙爾直隸撫民廳，后改為焉耆府，轄輪臺(tái)、新平、若羌3縣，包括庫(kù)爾勒、和碩、和靜等地。
庫(kù)爾勒屬焉耆府，幅員七十余里，人口四千余戶，地理位置之重要于焉耆相等而商務(wù)繁盛。
1920年新增添焉耆、和闐兩道，庫(kù)爾勒隸屬焉耆道管轄。
1930年10月，設(shè)置庫(kù)爾勒設(shè)治局，區(qū)劃仍隸屬焉耆行政區(qū)。
1939年4月，正式將庫(kù)爾勒設(shè)治局改為庫(kù)爾勒縣，屬焉耆行政區(qū)轄。
1943年，設(shè)焉耆行政督察專員公署，庫(kù)爾勒縣歸其管轄。
1950年4月13日，成立焉耆專員公署，6月成立庫(kù)爾勒縣人民政府。
1954年6月，撤銷焉耆專員公署，分設(shè)巴音郭楞蒙古自治州和庫(kù)爾勒專署，庫(kù)爾勒縣歸庫(kù)爾勒專署管轄。
1960年12月2日，庫(kù)爾勒專署并入巴音郭楞蒙古自治州，庫(kù)爾勒縣歸巴州管轄，為自治州首府。
1979年10月，由庫(kù)爾勒縣分設(shè)庫(kù)爾勒市。
1984年4月，撤銷庫(kù)爾勒縣建制，并入庫(kù)爾勒市。