1955年10月耿馬成立傣族佤族自治縣，所下設的5個區(qū)58個鄉(xiāng)編制中，芒佑屬58個鄉(xiāng)之一，隸屬勐永區(qū)。
1969年4月，勐永區(qū)改稱為永忠公社，芒佑鄉(xiāng)改稱為芒佑大隊，隸屬永忠公社。
1984年2月至5月，實行農村政社合一體制改革，原永忠公社改稱為勐永區(qū)，芒佑大隊改稱為芒佑拉祜族鄉(xiāng)，隸屬勐永區(qū)。
1988年1月至4月，實行區(qū)鄉(xiāng)體制改革，區(qū)改鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），鄉(xiāng)改村公所；勐永區(qū)改稱為勐永鎮(zhèn)；芒佑拉祜族鄉(xiāng)改稱為芒佑村辦事處，隸屬勐永鎮(zhèn)。
2000年實行村級體制改革，村公所（辦事處）改為村民委員會，芒佑村辦事處改稱為芒佑村民委員會至今，隸屬勐永鎮(zhèn)。
由于駐地較遠不方便群眾辦事的原因，于1991年1月，由老芒佑村（戶愛村）遷至新芒佑村。