瀘水縣境西漢時屬益州郡的比蘇縣。
東漢、西晉、東晉時屬永昌郡。
宋代屬金齒郡。
明末清初置老窩、六庫、登埂、卯照、魯掌五土司,分屬大理府的云龍縣及永昌府的保山縣。
1913年,為邊防需要,將五土司地設(shè)為瀘水行政委員區(qū),仍保留土司制度,隸屬騰越道。
1929年,設(shè)瀘水督辦,屬騰沖第一殖邊督辦公署管轄。
1932年,改設(shè)瀘水設(shè)治局,仍屬騰沖督辦公署。
1950年1月13日,瀘水縣宣布和平解放,同時成立瀘水人民臨時政務(wù)委員會,設(shè)署于魯掌,同年6月1日,成立瀘水設(shè)治局,隸屬于保山專區(qū)。
1951年2月,成立瀘水縣人民政府,名稱沿用至今。