解放前屬新?lián)徉l(xiāng)第三保,1949年解放,1950年為新?lián)釁^(qū)第三行政村,1953年在南京街建立南京鄉(xiāng)政府,駐地南京街,1958年冬劃歸古城公社為南京管理區(qū),1962年為南京公社,1968年改為南京大隊(duì),1984年春體制改革改為南京鄉(xiāng),1988年3月撤區(qū)建鄉(xiāng),改為南京行政村,2000年12月村改委改為南京村民委員會(huì),2012年12月28日,經(jīng)云南省人民政府批準(zhǔn)撤銷古城鄉(xiāng),設(shè)立古城鎮(zhèn),為古城鎮(zhèn)南京村民委員會(huì)至今。