清屬寧�？h西洞莊。
民國時巡檢司、小蒲店屬永豐鄉(xiāng)；民國赤礁、西渡斗門屬六鰲鄉(xiāng)。
1949年解放后巡檢司、小蒲店屬永豐鄉(xiāng)；赤礁、西渡斗門屬六敖鄉(xiāng)。
1950年8月由六敖鄉(xiāng)、永豐鄉(xiāng)分設，屬西洞鄉(xiāng)。
1955年赤礁、西渡斗門與西渡斗門村聯(lián)合成立第一、第二初級社。
1956年赤礁、西渡斗門轉為赤礁高級社；巡檢司、小蒲店成立巡檢司初級社，屬蒲西鄉(xiāng)。
1957年巡檢司、小蒲店并入小蒲高級社。
1958年11月屬蒲西管理區(qū)。
1961年巡檢司、小蒲店屬蒲西公社巡檢司大隊（1966年改名蒲西大隊，1982年恢復原名）；赤礁、西渡斗門屬蒲西公社赤礁大隊。
1984年屬蒲西鄉(xiāng)巡檢司、赤礁村。
1992年5月撤區(qū)擴鎮(zhèn)并鄉(xiāng)時，撤銷蒲西鄉(xiāng)，改屬六敖鎮(zhèn)巡檢司、赤礁村。
2013年11月屬健跳鎮(zhèn)巡檢司、赤礁村。
2018年8月20日行政村規(guī)模調，原巡檢司村、赤礁村調整為新的巡檢司村村民委員會。