宋至清初，稱深水山和莆岙山。
宋乾道《四明圖經(jīng)》卷七：“深水山，在縣東北九百五十里”“莆岙山，在縣東北九百五十里”。
明嘉靖《籌海圖編》卷一載為“莆岙”。
嘉靖《兩浙海防類考》：“若東北風(fēng)急，則過落星頭而入深水、蒲岙，到蒲岙而風(fēng)轉(zhuǎn)東，則入大衢沙塘岙而進長涂……此陳錢向正西之程也�！睋�(jù)考證，深水岙乃現(xiàn)南港附近區(qū)域，莆岙也作蒲岙，乃今峙岙附近區(qū)域。
明末以來，多稱黃龍山、大黃龍山或黃隴山，清光緒《崇明縣志•汛地圖》載為“大黃龍山”，以其西側(cè)的小黃龍島派生得名。
1934年以大黃龍島南部區(qū)域設(shè)黃龍鄉(xiāng)，屬定�？h。
以主島大黃龍島得名。
1949年7月至1950年5月屬滃洲縣。
1951年劃入大黃龍島北部的峙岙、黃沙岙、大岙等村，屬嵊泗縣，自此結(jié)束大黃龍島分屬江蘇、浙江兩省的歷史。
1953年改為黃龍生產(chǎn)大隊。
1962年設(shè)黃龍公社。
1984年復(fù)設(shè)鄉(xiāng)。